教育・文化の向上と観光の振興に資することを目的に記念館となりました。

青函連絡船記念館摩周丸は函館駅の裏側の函館湾沿いに大きな船が係留されています。
こちらが青函連絡船記念館摩周丸です。この摩周丸は１９６５年に就航した津軽丸型の５番目の船で、実際に青函連絡船として使用していましたが１９８８年の青函トンネルの完成とともに役目を終え、旧青函連絡船摩周丸を函館港の港湾文化交流施設として保存・活用し、青函連絡船の歴史を広く伝えるとともに、その利用により教育・文化の向上と観光の振興に資することを目的に記念館となりました。
１９９１年からはメモリアルシップ摩周丸として公開されていましたが経営母体の破綻等で閉館となり、紆余曲折の上２００３年に青函連絡船記念館摩周丸としてオープンしました。
船内には歴代青函連絡船の模型や歴史、１９５４年の洞爺丸台風での海難事故をパネル展示した青函連絡船のあゆみがあり、実際に使用していたグリーン指定椅子席や普通椅子席に座ることもできます。また船のしくみでは船で使う航海用具や航海日誌、制服、歴代青函連絡船の模型があり、青函連絡船の構造や仕組みを映像やパネルで解説しています。
そして船橋にある操舵室や無線室は当時のままに再現しており、舵輪や各種操船機器にも触ることができます。
函館山が一望できるサロンにはテーブルが用意され、弁当などの持ち込みもできる他、記念撮影用の船長服もあります。